Missionsfondens formål er at støtte evangelisk kristent missionsarbejde i både ind- og udland
 
For at opfylde dette formål, indsamler Missionsfonden penge til både specifikke og ikke specifikke projekter, som fonden enten er knyttet til eller har optaget i sig, eller som fondens bestyrelse i øvrigt finder støtteværdige
 
Missionsfondens daglige administration varetages af een enkelt medarbejder, og dette sammen med at fonden ledes af en ulønnet bestyrelse gør, at administrationsomkostningerne holdes på et minimum på 15%
 
Bestyrelsen er Missionsfondens ledelse, og det er også bestyrelsen, der alene afgør, om et projekt er støtteværdigt, og hvor meget der skal uddeles i støtte
Webbureauet Krogstrup & Hede